Dit document bestaat uit de portfolio opdracht horend bij het vak Ontwerp en Synthese, dit document kan worden gebruikt als ondersteuning bij het schrijven van je eigen portfolio. PS let op plagiaat
Introduction…………………………………………………………………………...3
Cheminformatics…………………………………………………………………….4
PubChem………………………………………………………………………………..9
Bioinformatics……………………………………………………………………….11
Proteins in 3 dimension…………………………………………………………21
References…………………………………………………………………………….24
2
, Introduction
This portfolio provides some important insights in the field of medicinal chemistry. Medicinal
chemistry analyses the interaction between a ligand and its target, to give information about how
and why a chemical compound works. Medicinal chemistry investigated specific drug mechanisms of
action, structure-activity relationships (SAR), acid-base and physicochemical properties and the
absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) [1]. All these information
medicinal chemistry provides plays a major role for the discovering and developing of new drugs.
Thereby it is also important for the drug’s safety. Therefore medicinal chemistry plays a major role in
the pharmaceutical sciences.
The pharmaceutical sciences has two important terms: cheminformatics and bioinformatics. The
discipline Cheminformatics is first defined by Brown in 1998. Cheminformatics is defined as the
mixing of information resources to transform data into information, and information into knowledge
for the intended purpose of making better decisions faster in the area of drug lead identification and
organisation[2]. Cheminformatics is all about the analysing of chemical structures. The discipline
bioinformatics is first defined by Paulien Hogeweg in 1988. Bioinformatics is the study of informatics
processes in biotic systems and has the focus on analysing of sequence. Bioinformatics focused
towards the protein structures. Therefore it plays a major role in the pharmaceutical sciences
because most drugs targets are proteins.
Cheminformatics, bioinformatics and medicinal chemistry has all journals with studies and articles
about their subject. The impact factor (IF) is a measure of the frequency with which the average
article in a journal had been cited in a particular year[3]. For each of the three disciplines there will
be give an example: the European journal of Medicinal Chemistry (IF: 4.816 (2017))[4],The journal of
cheminformatics (IF: 3.8935 (2017/2018))[5] and the journal bioinformatics (IF: 5.481 (2017/2018)).
In this portfolio there has been done research in four topics: cheminformatics, PubChem,
bioinformatics and proteins in 3 dimension. For cheminformatics there were analysed three drugs:
Cisatracurium Besylate, Sunitinib and Bosetan. With PubChem there was done a similarity test with
the earlier mentioned drugs. For bioinformatics, the DP 1 receptor was analysed as well as the DP2
receptor. Also five other class A receptors were together analysed. With proteins in 3 dimension,
there was analysed the prostaglandin D2 receptor with its ligand Fevipiprant.
.
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper fran98. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,99. Je zit daarna nergens aan vast.