Samenvatting
Summary Part 2 -- Phylogenetic reconstruction
This is a summary of part 2 Phylogenetic reconstruction of Evolutionary Development. With all of my summaries for this course I passed it with an 7,7 !
[Meer zien]Voorbeeld 1 van de 3 pagina's
Voorbeeld 1 van de 3 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Phylogenetic reconstruction: evolutionary relationsamong species
Principle phylogenetic reconstruction
Phylogenetic used to see where species fit in whole biodiversity
follow species back to find common ancestors
Do this because related groups have many acquired/derived
characteristics in common
Synapomorphy: derived characterises are shared in 2 or
more taxa and thus originate from single common ancestor
Biological datasets and their characteristic
Terms:
- Taxon(taxa): species/population
- Branch (clade)
- Outgroup: no derived character states (this is not
always the case see the workgroup). It is the common
ancestor of all taxa. Branches off before the ingroup
- Synapomorphy; shared derived trait in 2 or more taxa
- Autapomorphy: derived trait present in single taxon
- Monophyletic group; ancestor including all descendants;
share common ancestor (with one cut the group is
removed from the tree)
- Paraphyletic group; ancestor but not all descendants (with
two cuts the group is removed from the tree) (still only one
set is included)
- Polyphyletic group; subgroups without recent common
ancestor (cut twice)
How are character states ordered?
1. Unordered; each state can transfer to other state; eye
colour, DNA, AA
2. Ordered; anatomy of teeth
3. Irreversible; measure for brain content
Can you calculate a tree based on mutation in DNA?
- Molecular clock in mammals (time) (linear relationship between DNA change
and time
- Dating the origin of HIV-1 in human populations (time) (DNA isolation
DNA sequencing alignment (opstelling) phylogeny)
Phylogenetic methods
Genetic distance: UPGMA (unweighted (ongedwongen) pair group method
using arithmetic (rekenkundige) means(middelen)): Does not take evolutionary
information into account
Variable characteristics are converted into a matrix of genetic distances the
2 most related species are connected recalculate the distance matrix with
the 2 most related species connect the most related groups and repeat the
procedure
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper biomedicalsciencesvu. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 60904 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen