Genetics & genomics
Sequencing of the genetic code
Chromosome nucleosomes chromatin (DNA is condensed with the aid
of histones) DNA double helix
Histones: 2H2A, 2 H2B, 2 H3 and 2 H4
To make transcripts DNA should be accessible:
Histone modification: DNA become less tightly bound to histone
proteins
o Histone acetylation: addition of acetyl groups to histones
– DNA become more accessible to transcription factors –
euchromatin: loosely pakced form and generally active
o Histone deacetylation: removal of acetyl groups from
histones – DNA become less accessible to transcription
factors – heterochromatin: firmly packed form and
genetically inactive
o Nucleosome remodelling (change in structure)
DNA modification/methylation
DNA sequencing:
Method invested in 1976 by Fred sanger;
Chain-termination method: making many DNA product with
the use of enzymes and terminate the reaction – size of
product determines the next base in line
In 2003; the code is published
Later; advances went much quicker than expected because increase in computer-
storage
Measuring gene expression:
1. PCR methods
a. Relative expression
b. Work well for small number of genes
c. Real quantitative version is the best
2. Hybridization-based methods
a. Relative expression
b. Very popular between 2000-now because
of price
3. Sequencing-based methods (Tag-based)
a. Serial analysis of gene expression (SAGE)
– gene expression
b. Cap analysis of gene expression (CAGE) –
gene expression and promotor use (newest
one!)
Make cDNA and use CAP at 5’ end and add a linker to the CAP
sequence this and count number (=presence of transcripts)
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper biomedicalsciencesvu. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.