• Lab report : formal summary of activities & findings of experiment (grading)
Grade
• 70% lab report
• 30% exam
Lab journal (written)
,Lab report (typed)
- Dont search additional literature (e.g. google scholar)
Module 1: Western Blotting (HAP)
Western blotting 2 types of muscle tissue to determine myosin protein content in each of the tissue
samples.
General principles
,Electrophoresis => mitigation of charged particles under influence of electric field
• Particles move to cathode (+) or anode (-) -> depends on nature of their net
charge
- Many important molecules possess ionisable groups & are electrically
charged
- Amino acids, peptides, proteins, nucleotides & nucleic acids
• Equipment:
- Power pack
- Electrophoresis unit
• Electrophoresis unit for running 2 types of gel systems:
- Vertical slab gel => gel formed between 2 glass plates (separate
proteins in acrylamide gels)
- Horizontal gel => gel cast on glass or plastic sheet & placed on
cooling plate
• Buffer => maintain constant rate of ionisation of molecules being
separates
CL
Western blot (WB) => tool to separate & analyse proteins
• Separate proteins based on size
• Main principles
- Detection & separation of protein based on molecular weight
- Identify presence of specific protein & determine the level of relative expression in
sample
- Semi-quantitative technique => provides relative comparison of protein levels, no
absolute measure of quantity
, Work flow
1. Preparation of samples
2. Protein extraction
3. SDS-PAGE
4. Protein transfer
5. Blocking & antibodies incubation
6. Detection
Preparation of samples (1)
• Protein from 2 different murine muscles from mice
- Extensor digitorum longus (EDL) & soleus
• Check expression of myosin
Protein extraction (2)
Proteins collected in lysis buffer containing
proteinase inhibitors
SDS-PAGE (3)
• Dodecyl sulphate
polyacrylamide gel
electrophoresis
• Electrophoresis =>
describes mitigation of charged particle under influence of electrical
field
- 2-mercaptoethanol => break H2S bridges to unfold proteins
- SDS has – charge -> make whole protein negative
- Proteins will move to + pole
- Proteins with high molecular weight (larger proteins) will travel
less far/fast
Protein transfer (4)
• Protein transfer = blotting
- Wet transfer or semi-dry transfer
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper michouweimar. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,49. Je zit daarna nergens aan vast.