Dit zijn uitgebreide aantekeningen met plaatjes die zorgen voor verduidelijking van de onderwerpen. Universiteit utrecht, jaar 1 biologie, vak: PMO.
Deze aantekeningen van de kennisclips bevatten de volgende onderwerpen: RNA polymerase, σ factoren in E. coli, regulatie eiwitten, negatieve en po...
Kennisclips Regulatie
• Er vindt regulatie plaats op transcriptie, translatie en eiwit niveau → dit geldt voor alle
organismen
Prokaryoot vs eukaryoot
• Prokaryoten hebben een operon structuur (meerdere genen die afgeschreven worden vanaf een
enkele promotor → polycistronisch) en kunnen ook monocistronisch zijn
• Bij eukaryoten wordt er grotendeels maar 1 gen afgeschreven per promotor (monocistronisch)
• In prokaryoten is translatie en transcriptie gekoppeld
• Eukaryoten kunnen mRNA processen; introns, splicing, capping, transport vanuit de kern
RNA polymerase
• Bacteria heeft 1 soort van 5 subunits
• Archaea heeft 1 soort van 11-13 subunits
• Eukaryoten hebben 3 soorten van 12 of meer subunits
• Archaea en eukarya herkennen de TATA box en hebben een transcriptie factor nodig
RNA polymerase; bacteria
• Holoenzyme (gehele enzym) bestaat uit 4 subunits: β β’, α, ω, σ
• Geen algemene transcriptie factoren nodig
• σ factor is betrokken bij de promotor herkenning
(daarna kan de rest binden)
• Core enzyme: β β’, α, ω is betrokken bij de elongatie
→ Terwijl het RNA nog wordt afgeschreven wordt het
al afgelezen door ribosomen
• De σ factor herkent 2 sequenties waarvan één 35
nucleotiden (Consensus → TTGACA) en de ander
10 nucleotiden (Pribnow box → TATAAT) van de
transcriptie start
• Na het herkennen bindt het holoenzyme aan de
promotor waardoor de transcriptie kan beginnen
• De σ factor laat los en het core enzym gaat verder
met de transcriptie en maakt mRNA tot het bij de
transcriptiestop komt
Alternatieve σ factoren in E. coli
• σ 70: algemene σ factor waar de meeste promotors door herkend worden; transcriptie van
huishoud genen
• Er worden ook andere alternatieve σ factoren gemaakt onder bepaalde condities, die dan
ingeschakeld worden → deze concurreren met σ 70 waarbij ze binden aan de rest van RNA
polymerase en een andere set van promotors aanzetten die betrokken zijn bij de situatie
• Herkennen van andere sequenties
, DNA-bindende regulatie eiwitten
• Door te binden aan promotors in het DNA, de transcriptie blokkeren of laten verlopen
• Herkennen een speciale sequentie en vormen meestal dimeren → de sequentie is hierdoor vaak
een inverted repeat
• DNA sequenties zijn vaak inverted repeats
• In bacteriën is er vaak een helix-turn-helix motief (e.g. in het LacI repressor); bestaat uit een
helix die de sequentie in het DNA herkent, er aan bindt en de gen expressie reguleren, en een
helix die het motief stabiliseert
Positieve en negatieve regulatie
• Positieve regulatie:
- Is een activator die transcriptie mogelijk maakt → zonder activator geen transcriptie
- De activator reageert op een signaal (de effector) die de activator reguleert
- Activator bindt aan acitvator-binding site en transcriptie kan plaatsvinden
• Negatieve regulatie
- Is een repressor die de transcriptie blokkeert → als de repressor uitgeschakeld is, is er
transcriptie
- De repressor bindt aan een bepaalde sequentie → de operator
- Effector reguleert de repressor
- Repressie en inductie
Rood = Activator-binding site Geel = Operator
• Het LacI gen zorgt voor de transcriptie van de repressor
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper guillaine2000. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €2,99. Je zit daarna nergens aan vast.
