Een samenvatting van de kennisclips, gebaseerd op H2, H3 en H4 van het boek "Introduction to Biotechnology: Pearson International Edition" geschreven door William J. Thieman, Michael A. Palladino. Hierin wordt de stof uitgelegd voor zowel het eerste als tweede deeltentamen voor het van Biotechnolog...
- Het recombineren van verschillende DNA moleculen tot een nieuw molecuul
DNA is een polymeer van nucleotden, waarbij elke nucleotde is opgebouwd uit een suikergroep, een
fosfaatgroep en een base. Aan de ene kant eindigt DNA met de fosfaatgroep: het 5’ uiteinde en aan
de andere kant met de suikergroep: het 3’ uiteinde.
- de ene loopt van 3’ -> 5’ en de ander van 5’ -> 3’
Denaturate: DNA verhiten
tot een specifeke temperatuur waardoor de
waterstofruggen verbreken en dubbelstrengs DNA enkelstrengs DNA
wordt
Renaturate: Verlaging van de temperatuur waardoor twee stukken
DNA spontaan weer basenparen
Het centrale dogma
- Transcripte: van DNA -> mRNA
- Translate: van mRNA -> eiwit
Verschillen tussen prokaryoten (pro = voor, karyon = kern) en eukaryoten (eu= echt)
- Genetsch materiaal
o Eukaryoten
Lineaire chromosomen
DNA zit om histonen heen gewonden
DNA + eiwiten (histonen) = chromatne
1
, DNA is vaak diploïd
o Prokaryoten
Eén circulair chromosoom
DNA is haploïd
Bevaten ook vaak plasmiden
Draagt info die niet essenteel is
Draagt info die vaak wel een selectef voordeel biedt
o (resistente tegen een antbiotcum)
- DNA replicate
o Prokaryoten
Begint bij de Origin of replicaton (ORI)
Een bepaalde DNA sequente
waaraan eiwiten binden die
betrokken zijn bij replicate
De strengen gaan uit elkaar en er
ontstaan twee replicate vorken
In prokaryoten zit meestal maar één ORI
o Eukaryoten
Vaak per chromosoom meerdere ORI’s
Hierdoor is het mogelijk om
grotere genomen (zoals het
humane) toch snel te repliceren
DNA replicate (Eukaryoten)
- Helicase: haalt de twee DNA strengen uit elkaar
- Single stranded binding proteins: zorgen ervoor dat het DNA ook enkelstrengs blijf
- Primase: maakt een RNA primer van 10-15 nucleotden lang
- DNA-polymerase III: bouwt nieuwe nucleotden aan de primer, in de 5’-> 3’richtng
o Leading strand: synthese aan deze streng vast gebeurt in één keer
o Laging strand: synthese aan deze streng gebeurt in (Okasaki) fragmenten
(prokaryoten: 1000-2000 nucleotden lang, eukaryoten: 100-200 nucleotden lang)
- DNA-polymerase I: vervangt RNA primer voor DNA nucleotden
- Ligase: zorgt voor de vorming van covalente bindingen tussen de DNA fragmenten
Verschillen tussen prokaryoten en eukaryoten
- Transcripte-translate
o Prokaryoten
Door gebrek aan een celkern is het een gekoppeld proces
Transcripte begint door binding van RNA-polymerase aan de promotor
Promotor: Pribnow box
Voor deze binding zijn geen algemene transcriptefactoren nodig
Genen kunnen gestructureerd zijn in een operon structuur
Eén promotor, één gen: monocistronisch
Eén promotor, meerdere genen: operon structuur (polycistronisch)
2
, Een operator is de sequente in het operon die de transcripte
reguleert door de binding van repressors of inducers
o Eukaryoten
Door de celkern zijn transcripte en translate gescheiden processen
Transcripte begint door binding van RNA-polymerase aan de promotor
Promotor: TATA-box
Voor deze binding zijn algemene transcriptefactoren nodig
Genen kunnen niet gestructureerd zijn in een operon structuur
mRNA moet eerst geprocessed worden door het getransleerd wordt
mRNA processing in eukaryoten in eukaryoten
- Splicing: mRNA bevat intronen en exonen, de intronen moeten verwijderd worden
- 5’ capping: aan het 5’ eind wordt een gemodifceerde guanine nucleotde toegevoegd
- Poly-A-staat: aan het 3’ eind wordt een reeks adenine nucleotden toegevoegd
- De 5’cap en poly-a-staart zijn
belangrijk voor export van het mRNA
uit de kern, voor bescherming tegen
afraak, maar ook voor de eerste stap
van de translate
Translate
- Initate van translate
o Eukaryoten
De kleine subunit van
de ribosoom herkent
de cap structuur met behulp van initatefactoren
Dan verplaatsen de kleine subunit over het mRNA tot het startcodon
Hierna binden het initator tRNA en de grote subunit van het ribosoom
o Prokaryoten
De kleine subunit van de ribosoom herkent de Shine Delgarno sequente (of
ribosoom binding site) met behulp van initatefactoren
Hierna bindt het initator tRNA en dan de grote subunit van het ribosoom
Codonpreferente
Er zijn 64 codons, waaronder 3 stopcodons en een startcodon, er zijn dus voor eenzelfde aminozuur
meerdere codons mogelijk. Hoewel de genetsche code universeel is zijn er wel verschillen in welke
codons vaan gebruikt worden. Hiermee moet rekening worden gehouden want een afwijkend codon
kan efect hebben op de efcicnte waarmee een codon geproduceerd wordt.
Regulate
- Chromatne structuur
o DNA zit om histonen heen gewikkeld: een groep van 8
eiwiten, elk met een staart waaraan moleculen kunnen
binden die de regulate beïnvloeden
Methylering: DNA krijgt een compactere structuur
3
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper mathilda-van-breest. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €3,49. Je zit daarna nergens aan vast.