College aantekeningen

Voortgezette Statistiek en 'R' - hoorcollege - t/m week 5

0 keer verkocht

Instelling
Universiteit Utrecht (UU)

Boek
The Analysis of Biological Data

Dit zijn de aantekeningen gemaakt tijdens de hoorcolleges van Voortgezette Statistiek en 'R'. Het vak wordt gegeven aan de Universiteit Utrecht.

[Meer zien]

Laatste update van het document: 1 maand geleden

Voorbeeld 2 van de 40 pagina's

Bekijk voorbeeld

Geupload op 16 november 2024
Bestand laatst geupdate op 14 januari 2025
Aantal pagina's 40
Geschreven in 2024/2025
Type College aantekeningen
Docent(en) Erika tsingosi & yann hautier
Bevat Alle colleges

statisiek
hypothese
analysis
data
whitlock
schluter
third edition
advanced statistics and r
biology
advanced statistics
rstudio
function
formula
r

Volgen

Ribizlik Lid sinds 5 jaar 155 documenten verkocht

€7,16

In winkelwagen

Op verlanglijstje

100% tevredenheidsgarantie
Direct beschikbaar na je betaling
Lees online óf als PDF
Geen vaste maandelijkse kosten

LECTURE 1 – WEEK 1: about this course + R and RStudio VSR

SEMESTER 1 | ERIKA TSINGOSI + YANN HAUTIER

ABOUT THIS COURSE

● learning goals
○ expand statistics toolbox
○ reason about appropriate experimental approaches
and statistical tools
○ critically evaluate analyses and outputs
○ learn the basics of data science
○ master the tools for creating a reproducible analysis
in R
● final grade must be ≥ 5.5
○ attend all computer sessions ● ?lm or help(lm) gives you help on the lm function
○ complete weekly quizzes ● helpful sources
○ complete all 4 hand-in assignments (30%) ○ http://tryr.codeschool.com/
○ pass the exam with a grade ≥ 5.5 (70%) ○ http://www.cookbook-r.com/
○ https://thecrashcourse.com/courses/what-is%20stat
istics-crash-course-statistics-1/
R AND RSTUDIO
● outlier has a huge impact on linear regression

● statistics are done in R not RStudio; Rstudio is the tool
○ RStudio is an IDE for R
● you have to annotate your script using #
● R automatically creates a code when you click on Import
Dataset which you need to paste in the script and save
● library() #get a list of all installed packages
● install.packages("ggplot2") #to install a package
● library(‘’ggplot2’’) #to load a package
○ no need to install a package again after it has been
installed, but it’s important to load it again
● hand in assignments need to be in pdf

● ggplot2 = grammar of graphics
○ https://ggplot2.tidyverse.org/
○ http://www.cookbook-r.com/Graphs/

1

, LECTURE 2 – WEEK 1: fundamentals of statistics VSR

SEMESTER 1 | ERIKA TSINGOSI + YANN HAUTIER

○ n – 1 is used because you might get outliers by chance
FUNDAMENTALS OF STATISTICS when you take a sample
⎯ sample measurements are on average closer to their
own mean than to the true mean of the population;
SAMPLING
subtracting by 1 can correct for that bias when the
sample size is small
● flowchart of a study ○ Ȳ is a random variable
○ execution; while you're collecting data, you should already
make plots to see if the data makes sense

● to find the distribution of Ȳ we sample multiple times
○ when you add the different samples, you get the sampling
distribution of the sample mean Ȳ
○ sampling distribution of Ȳ is a t-distribution
⎯ t-distribution has a lower peak and fatter tails than the
normal distribution
● statistics quantifies uncertainty; statistics is about making sense
of the variation (in samples)
○ descriptive statistics quantify
⎯ location or central tendency of data; mean, median
⎯ spread of the data; range, standard deviation
○ comparative statistics
⎯ compare different groups
⎯ based on location and spread
⎯ How likely is the sample compatible with our
expectation?
● population distribution; ideal value we’d know if we’d have
perfect knowledge of measured individuals (almost always
impossible to measure)
○ most common measures for location and spread for a
population distribution are mean (μ) and standard
deviation (σ)
⎯ μ: sum of each individual measurement divided by the ○ mu hat: mean of the sampling distribution of Ȳ
total number of measurements which is an estimate for the population mean (μ)
⎯ σ: you square each measurement subtracted from the ⎯ you sum the sample means and divide it by the
mean → sum the squares → divide it by the total
number of samples
number of measurements → take square root;
○ σȲ = standard deviation of the population / square
standard deviation is the square root of the variance
⎯ population μ and σ are constant (they are not random root of the sample size
and don’t change, because the population is always ○ we usually don’t have the population standard
the same) deviation σ → that's why we estimate the spread of
Ȳ (standard error of the mean) with the sample
standard deviation s
⎯ the estimate is the standard error of the mean =
sample standard deviation / square root of the
sample size

● sample distribution; random subset of the population
○ sample mean (Ȳ) and sample standard deviation (s)

2

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Direct to-the-point

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper Ribizlik. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €7,16. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 69411 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Begin nu gratis

College aantekeningen

Voortgezette Statistiek en 'R' - hoorcollege - t/m week 5

Document informatie

Onderwerpen

Gekoppeld boek

Meer samenvattingen voor studieboek

Geschreven voor

Verkoper

Ontvangen beoordelingen

Voorbeeld van de inhoud