100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na betaling Zowel online als in PDF Je zit nergens aan vast
logo-home
Samenvatting Deeltentamen 2 ontwikkelingsbiologie 2020 universiteit utrecht €4,99
In winkelwagen

Samenvatting

Samenvatting Deeltentamen 2 ontwikkelingsbiologie 2020 universiteit utrecht

2 beoordelingen
 155 keer bekeken  12 keer verkocht

Complete samenvatting van 31 pagina's voor het tweede deeltentamen van het vak ontwikkelingsbiologie aan de universiteit utrecht. Het bestand bevat samenvattingen van alle hoorcolleges, inclusief die van bio ethiek en het kip 2 practicum. Bevat hoorcolleges 2, 6 en 8

Voorbeeld 8 van de 31  pagina's

  • Onbekend
  • 5 oktober 2020
  • 31
  • 2020/2021
  • Samenvatting
book image

Titel boek:

Auteur(s):

  • Uitgave:
  • ISBN:
  • Druk:
Alle documenten voor dit vak (51)

2  beoordelingen

review-writer-avatar

Door: rileykonijnenberg • 3 jaar geleden

review-writer-avatar

Door: SennaKraan • 4 jaar geleden

avatar-seller
roosbakker
Ontwikkelingsbiologie Deeltentamen 2 – 2020
HC 2.1 development of Drosophila
Life cyclus
 De levenscyclus is maar ongeveer 10 dagen,
daarom zijn ze erg geschikt voor onderzoek.
Hierdoor komen er ook snel nakomelingen
 Veel genen zijn ook al bekend
Early embryo
Het vroege embryo is een syncytium
 Syncytium
o Snelle mitose met alleen kerndeling
o Kernen migreren naar de buitenkant en
vormen het syncytial blastoderm
 Morphogen gradient
o Tussen de kernen heb je signaleringsmoleculen
o Geven positionele informatie
o In het begin zijn dit transcriptiefactoren, hoeven nog geen transmembraan
moleculen te zijn aangezien het een groot cytoplasma is




Gastrulatie (zie COO)
 Zorgt voor positionering van de drie kiemlagen
o Ectoderm, mesoderm en endoderm
 Cellen van het zenuwstelsel bewegen aan de ventrale kant naar binnen
 Endoderm en mesoderm bewegen ook naar binnen
 Foregut en de hindgut groeien ook naar binnen
Germ band extension and segmentation
 Het embryo vouwt dubbel tijdens de gastrulatie door germ band
extension. De yolk gaat het embryo niet uit doordat het
amnioserosa dit voorkomt
 Er ontstaan inkepingen in het embryo waardoor er 14
parasegmenten ontstaan
o 3 monddelen en hoofd
o 3 thorax delen
o 8 abdomen (buik) delen
 Vervolgens ontvouwt het embro weer  germ band retracts
 Vervolgens is er sprake van dorsal closure, weefsel van de zijkant
groeit over de yolk en vervangt amnioserosa

,From larva to fly
Larve heeft aan de onderkant Denticles  haartjes om te bewegen. De
larve vervelt elke keer om verder te groeien totdat hij een pop vormt.
Dan ondergaat hij metamorphose en vormt het een vlieg.
 Hoofd heet acron
 Staart heet telson
Patterning of the embryo

Anterior-posterior as

 Hoofd
 Thorax
 Abdomen

Dorsaal-ventraal as

 Mesoderm
 Ventraal ectoderm
/neuroectoderm
 Dorsaal ectoderm
 Amnioserosa



Anterior-posterior en dorsaal-ventraal patterning in het embryo

Van anterior naar posterior is er al een verschil in de expressie van eiwitten, de cellen zijn dus al
vroeg gespecificeerd  dit gebeurd al in de oocyt  dit komt door maternal products, eiwitten
afkomstig van de moeder

Drosophila oogenesis

Eicellen zitten als een ketting aan elkaar en rijpen

 Stam cellen delen in andere stamcellen en een cystoblast
 De cystoblast verdeelt zich in 16 onderling verbonden cellen
o Vormt door 4 mitotische delingen de germline cyst
 Deze germline cyst vormt vervolgens de egg chamber
 Een van de 16 cellen wordt een oocyt, de andere veranderen in nurse cells
o Nurse cells geven maternele producten (mRNAs) aan de oocyt en gaan uiteindelijk
dood
 Somatische follikel cellen omgeven de 16 cellen en vormen de buitenkant van de egg
chamber

,Anterior-posterior polarisatie van Dropsophila oocyt

 De oocyt beweegt naar de posterior as door signalering van de voorliggende oudere egg
chambers, dit gebeurt door signalering routes
 Er is ook cell fate specificatie van bepaalde follikel cellen, zo heb je anterior en posterior
follikel cellen

pathway

 De nurse cellen van de oudere egg chamber produceren delta, dit
interacteert met Notch en polariseren de anterior follikel cellen (rood)
 De polaire follikel cellen (rood) produceren een ligand voor de JAK/STAT
route en die induceren de stalk cellen (groen)
 De Stalk cellen produceren cadherine en binden aan posterior kant van
de jongere oocyt
 De kern van de oocyt beweegt vervolgens ook naar de posterior kant
waar de stalk cellen hechten
 Aan de posterior kant van de linker oocyt wordt gurken mRNA
getransleerd. Dit wordt gesecreteerd en gaat een interactie aan met
Torpedo. Dit polariseert follikel cellen tot posterior follikel cellen.
 Posterior follikel cellen reorganiseren de microtubuli van het cytoskelet
waardoor de kern weer naar anterior kant wordt geduwd door het
centrosoom.
 Waar de kern eindigt (rechts of links) vormt ook de dorsale kant. Dorsale
follikel cellen worden geinduceerd door gurken, gaat mee met de kern.

,HC 2.2 development of Drosophila
Localisatie maternal mRNA
 Maternele mRNA’s en eiwitten worden specifiek gelokaliseerd in de oocyt door microtubuli.
o Dynein motoreiwit loopt naar de min kant
o Kinesin motoreiwit loopt naar de plus kant
 Bijvoorbeeld
o Bicoid - gaat naar anterior (-), zorgt daar voor patroonvorming
o oskar + gaat naar posterior(+), zorgt voor vorming toekomstige geslachtscellen en
lokaliseert nanos mRNA
Nurse cells, Oocyte and Follicle cels
 nurse cells
o geven maternaal mRNA en eiwitten aan oocyte
 follikel cellen
o zitten rondom oocyte en nurse cellen
o hebben verschillende cel “fates” in verschillende regio’s
o determineren de A-P as en de D-V as
De A-P as
 eiwit synthese start pas na bevruchting, behalve gurken
 de A-P as wordt opgezet door maternale genen en zygotische genen (zie hieronder) 
o gap genen
 als het er niet is mist een deel van de larve
o pair rule genen
 vormen segmenten
o segment polariteits genen
o selector genen bepalen
identiteit
Opeenvolgende expressie van genen
Temporele volgorde:
 eerst maternale genen
o door moeder in het ei
gelegd, diffunderen in
syncytium
 dan zygotische genen
o uitgegeven door embryo
 selector genen
o homeobox genen
drie klassen maternale genen
 anterior
o bicoid, hunchback
 posterior
o nanos, caudal
 Terminal (bepaalde de eindes, de kleine uitsteeksels)
o Torso, trunk

,Anterior maternale genen (zie samenvatting volgende pagina voor korte functie genen)
Bicoid is nodig voor anterior structuren
Na injectie van wild type cytoplasma bij bicoid mutant ontstaan er toch nog een soort anterior
structuren. Als je bicoid in het midden van het lichaam van de mutant plaatst ontstaan daar anterior
structuren.
 Bicoid is een morphogen, aangezien de cellen anders worden afhankelijk van concentratie
bicoid (gradient belangrijk)
Bicoid is een homeobox achtig gen
 Het is een transcriptie factor
 Het activeert zygotische genen
 Kan RNA binden
 Het eiwit heeft een korte levensduur om een gradient te vormen
Bicoid nuclear gradient
In een onbevrucht ei zit het bicoid mRNA anterior. Er zijn eiwitten die het mRNA localiseren.
 Na bevruchting
o Eiwit wordt aangemaakt en zie je in de kernen, hier heeft het ook zijn functie
o Gradient van het eiwit is het hoogst aan de anterior kant
 Bicoid activeert hunchback aan de anterior kant, zit anterior vast aan het cytoskelet
 Bicoid homeodomein bind ook aan caudal mRNA
o Het voorkomt binding van het cap-binding complex en onderdrukt hiermee de
initiatie en translatie van caudal aan de anterior kant, waardoor hier geen caudal
aanwezig is


Bicoid functies samengevat
 Transcriptie factor
o Het activeert hunchback transcriptie aan de anterior kant
 RNA-binding eiwit
o Onderdrukt caudal translatie aan de anterior kant


Hunchback
 Geactiveerd door bicoid
 Zn (zink) finger eiwit, eiwit dat gevouwen een soort vingers vormt waaraan Zn bindt
 Is een transcriptie factor
 beperkt tot de anterior zijde

,Posterior maternale genen
Caudal
De caudal gradient is het hoogst aan de posterior zijde
 Het is een homeodomein transcriptie factor
 Het zorgt voor de ontwikkeling van abdominale segmenten
Nanos
 Nanos mRNA aan posterior kant gelocaliseerd en verankerd aan het cytoskelet. Het mRNA
wordt getransleerd na bevruchting
 het vormt een gradient en is ook een Zn finger eiwit
 het kan RNA binden
 het heeft een onderdrukkende werking op de translatie van hunchback!!
Nanos vormt samen met Pumilio een complex en inhiberen samen de translatie, dus niet Nanos
alleen. Pumilio bind aan de NRE op de 3’ kant van het mRNA, aan Pumilio bind vervolgens Nanos.
Samenvatting belangrijkste maternale genen op de A-P as

Bicoid en Nanos niet door het hele embryo verspreid aangezien
ze verankerd zijn aan het cytoskelet, hunchback en caudal zijn
niet verankerd. Figuur voor translatie 


Bicoid en Nanos gradient na translatie stijl, door korte levensduur
kunnen ze niet helemaal diffunderen naar de andere kant. Figuur
na translatie 
 Hunchback (getransleerd door Bicoid) wordt posterior
onderdrukt door Nanos
 Caudal wordt anterior onderdrukt door Bicoid

Bicoid
Homeobox domein eiwit
 TF: activeert hunchback
 Onderdrukt caudal
 RNA binding/ translationele regulator
Hunchback
 Zn finger
 TF
Nanos
 Onderdrukt Hunchback
 Zn finger en RNA binding/translationele regulator
Caudal
Homeobox domein eiwit
 TF
HC 2.3 development of drosophilla

,Drie klassen maternal genes
 Anterior
o Bicoid, hunchback
 Posterior
o Nanos, caudal
 Terminal
o Torso, trunk
Torso specificeerd de terminale regios
Torso is een receptor waarvan het mRNA na de bevruchting wordt getransleerd. Het eiwit is
verspreid over het hele membraan maar is verantwoordelijk voor de uiteinden van het embryo. Het
moet dus geactiveerd worden aan de uiteindes door een ligand. Trunk is een ligand voor Torso.
Trunk wordt uitgescheiden in de perivitelline ruimte (ruimte tussen oocyt en buitenkant). Toch is het
ligand ook verspreid door het hele embryo, maar dan in inactieve vorm. Het moet dus actief gemaakt
worden. Dit gebeurd door Torso-like, dit wordt geproduceerd door de follikel cellen bij de polen.
Hierdoor is Torso alleen daar actief. Doordat er maar een kleine hoeveelheid actief ligand is en het
gelijk bind aan Torso is het niet verspreid door het hele embryo.
Torso
Getransleerd na bevruchting
 Transmembraan receptor voor tyrosine kinase
 Actief aan polen
 Uniform verspreid door embryo plasma
Trunk
 Ligand voor Torso
 uitgescheiden in perivitelline ruimte
 Uniform verspreid door embryo maar inactief
Torso-like
 Geproduceerd door follikel cellen bij polen
 Maakt het ligand Trunk actief
Actief Trunk
 In de perivitelline ruimte
 Kleine hoeveelheden
 Bind gelijk aan Torso en activeert tyrosine kinase kettingreactie
Tyrosine kinase
Torso is een tyrosine kinase. Het vormt een dimeer en kan zichzelf fosforyleren. Op deze
fosforilerings plekken binden eiwitten die op hun beurt weer gefosforyleerd worden, dit veroorzaakt
een hele cascade.




Dorsal-ventral polariteit

, Wordt gespecificeerd door maternale genen. Toll is zo’n gen. Toll specificeert verschillende “cel
fates” van dorsaal naar ventraal. Ventrale follikel cellen scheiden eiwitten (proteasen) uit die het
ligand Spätzle verwerken en actief maken. Deze eiwitten worden door Pipe gelokaliseerd en aan de
ventrale kant waardoor alleen daar het gen Toll actief wordt. Zodra Toll actief is bind het aan het
Tube eiwit, Tube activeert weer Pelle. Samen breken Tube en Pelle het eiwit Cactus af waardoor
Dorsal de kern in kan. Follikel cellen zijn dus belangrijk voor patroonformatie en lokale activatie van
receptors van het embryo.
Toll
 Receptor (ook tyrosine kinase)
 Getransleerd na bevruchting
 Uniform verspreid over hele embryo
Spätzle
 Ligand voor Toll
 Uitgescheiden in perivitelline ruimte
 Uniform verspreid over hele embryo
 Inactief ligand
Pipe

 Heparan sulfate sulfotransferase suikerketen
 Lokaliseerd Spätzle protease activiteit

Activatie van Toll lijdt tot lokalisatie van dorsal in kern

Toll heeft de cactus Dorsal pathway. Dorsal is een transcriptie factor die verantwoordelijk is voor de
Ventrale “cel fate”. Dorsal is uniform over het hele embryo verspreid, maar zit alleen in de ventrale
kant in de kern. Als er geen Toll signalering is zit Dorsal in het cytoplasma, Dorsal wordt namelijk
verankerd door cactus en kan dan niet de kern in. Als er wel Toll signalering is dan wordt cactus
afgebroken en komt Dorsal in de kern. Hier activeert het ventrale genen. Als Dorsal dus niet in de
kern komt krijgt je een gedorsaliseerd fenotype

Dorsal

 Transcriptie factor
 Uniform verspreid over embryo
 Gradient van dorsal specificeert D-V as

Toll signaling

 Cactus afgebroken
 Dorsal in kern
 Activatie ventrale genen

Dorsal binding sites

 Mesoderm
o Lage affiniteit voor dorsal, hoge hoeveelheid dorsal aanwezig
 Mesectoderm en neuroectoderm
o Gemiddelde affiniteit en hoeveelheid dorsal aanwezig
 Dorsal ectoderm, amnioserosa
o Hoge affiniteit, lage hoeveelheid dorsal aanwezig

Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Verzekerd van kwaliteit door reviews

Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!

Snel en makkelijk kopen

Snel en makkelijk kopen

Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.

Focus op de essentie

Focus op de essentie

Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper roosbakker. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €4,99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 53340 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Start met verkopen
€4,99  12x  verkocht
  • (2)
In winkelwagen
Toegevoegd