Samenvatting
Summary Organic chemistry & Biosynthesis lectures
Organic chemistry & Biosynthesis
[Meer zien]Voorbeeld 2 van de 12 pagina's
Voorbeeld 2 van de 12 pagina's
In winkelwagengesponsord bericht van onze partner
Voorbeeld van de inhoud
Organic and biosynthesisCrotti
20-10-2020
Natural products > fungi/bacteria > medicine
Organic compounds > primary metabolites (essential for life), e.g. carbohydrates, nucleic acids, fats,
AA > secondary metabolites: natural products (species specific, not essential for life, can be made out
of organic compounds).
Salicylic acid: plant hormone involved in infection response
Natural products as medicines:
- Possess broad chemical structure diversity
- Not produced by plant but with their ecological competitors
- Similar domains
Natural product biological activity: biological role of natural products
- End product of biosynthesis route (rubber)
- Attracting or repelling tools (essential oils, fragrances)
- Chemical weapon to gain advantages against other species (phytotoxins, phytoalexins,
antibiotics)
Chemical weapon – plant vs plant
- Allelopathy: one organism produces biochemicals (allelochemicals) that influence the growth
survival, development and reproduction of other organisms
- Phytotoxins: inhibition of other plants by poison or toxins, e.g. Juglone
Chemical weapon – plant vs microbes
- Phytoalexins: defence against attack, e.g. Viniferin and Resveratrol
Chemical weapons:
- Repellents: insecticides, e.g. Nicotine and Caffeine
- Antibiotics: chemical substances produced by microorganisms and having antagonistic effects
on the growth of other microorganisms
Applications of natural products:
- Drugs
- Toxins
- Fragrances, colours and flavours
- Others, e.g. Resins, Phenols, rubber, chemotaxonomy
More than 40% of new drug between 1981-2014 are from biological origin.
Digitoxin glycorandomization > digitoxigenin > anticancer potency and reduced inotropic activity.
, Secondary metabolism: the building blocks and construction mechanisms
The building blocks: very limited number
- C1: Carbon
- C2: Carbon
- C3: Fats, fatty acids, polyketides
- C4: Aromatic amino acids, phenylpropanoids
- C5: Terpenoids, steroids
- C6: Alkaloids
The building blocks: source and destination
- Shikimate route: aromatic amino acids, alkaloids
- Acetate route: simple carbon, fats/fatty acids/polyketides/flavonoids/steroids
- MVA/MEP route: isoprene units
- Acetate route-Krebs cycle: peptides/alkaloids
Assembly mechanisms:
- Alkylation: C-C (nucleophilic/electrophilic substitution/addition)
- Wagner-Meerwein rearrangements
- Aldol reaction / Claisen reaction: C-C
- Iminie formation / Mannich reaction: C-N
- Amino acids and transamination
- Decarboxylation
- Oxidation / reduction: C-C > C=C or C-OH > C=O
- Phenolic oxidative coupling C-C
- Halogenation reaction
- Glycosylation
Cofactors: compounds required for an enzyme’s activity to increase rate of a chemical reaction
- Prosthetic group: strong (covalently) bonded organic molecule, no protein
- Coenzyme (co-substrate): small organic substances, not covalent
e.g. NAD+, NADH, FAD, FADH2, ATP, ADP, CoA
Biosynthetic research: studying the sequence of reactions (=metabolic flux) and characterize the
enzymes in vivo. Nowadays, the intermediate molecules and enzymes can be studied.
Isotopic studies: isotopically labelled compound (precursor) > organism > produced metabolite >
isolation, purification, degradation, analysed > detect presence of isotope.
Voordelen van het kopen van samenvattingen bij Stuvia op een rij:
Verzekerd van kwaliteit door reviews
Stuvia-klanten hebben meer dan 700.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet je zeker dat je de beste documenten koopt!
Snel en makkelijk kopen
Je betaalt supersnel en eenmalig met iDeal, creditcard of Stuvia-tegoed voor de samenvatting. Zonder lidmaatschap.
Focus op de essentie
Samenvattingen worden geschreven voor en door anderen. Daarom zijn de samenvattingen altijd betrouwbaar en actueel. Zo kom je snel tot de kern!
Veelgestelde vragen
Wat krijg ik als ik dit document koop?
Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.
Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?
Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.
Van wie koop ik deze samenvatting?
Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper PharmacyHelp. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.
Zit ik meteen vast aan een abonnement?
Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor €5,49. Je zit daarna nergens aan vast.
Is Stuvia te vertrouwen?
4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)
Afgelopen 30 dagen zijn er 52510 samenvattingen verkocht
Opgericht in 2010, al 14 jaar dé plek om samenvattingen te kopen