Samenvatting

Molecules of life summary lectures

Name: Molecules of life summary lectures
SKU: doc_814517
Rating: 4.00 (1 reviews)
Author: noorbijvang

1 beoordeling

5 keer verkocht

Vak
Molecules of life

Instelling
Rijksuniversiteit Groningen (RuG)

Boek
Organic Chemistry

Summary of the lectures and part of the book from the course molecules of life. Given in the first year of biology at university of Groningen

[Meer zien]

Voorbeeld 3 van de 23 pagina's

Bekijk voorbeeld

Heel boek samengevat? Onbekend
Geupload op 8 september 2020
Aantal pagina's 23
Geschreven in 2019/2020
Type Samenvatting

1 beoordeling

Door: aguriencu • 4 jaar geleden

Volgen

noorbijvang Lid sinds 5 jaar 25 documenten verkocht

€4,49

In winkelwagen

Opslaan

100% tevredenheidsgarantie
Direct beschikbaar na je betaling
Lees online óf als PDF
Geen vaste maandelijkse kosten

Molecules of life
No multiple choice questions
Lecture 1 Mayer 24-02-2020 Chapter 1
Organic compounds: C, (N, H, O)
An organic compounds: everything else
Same structure of molecules show similarities in function
Structure of an atom:
• Consists of:
o Nucleus:
▪ Protons +
▪ Neutrons
o Electrons –
• Number of protons = number of electrons
• Electrons are important for chemistry

Periodic table:
• Top left corner: atomic number = number of protons
• Number under: 1 AMU
• 12 C & 13 C → difference in number of neutrons
Carbon dating: 14C 6 protons, 8 neutrons

Electrons are distributed in shells around the core: bohr model
• First shell: 2e-
• Second shell: 8e-
• Third shell: 18e-
• Fourth shell: 32e-
Electrons have wave like properties
Shells contain subshells: atomic orbitals
First shell Second shell Third shell
Atomic orbitals S S, P S, P, D
Number of atomic 1 1, 3 1, 3, 5
orbitals
Maximum number 2e 2, 6 e 2, 6, 10 e
of electrons

Core electrons: electrons in the inner shell
Valence electrons: electrons in the outmost shell
Relative energy of atomic orbitals: 1s < 2s < 2p < 3s < 3p < 3d

Three rules about ground state electron configuration
1. Aufbau principle: electron goes into the atomic orbital with the lowest energy
2. Pauli exclusion principle: no more than two electrons can be in an atomic
orbital
3. Hund’s rule: an electron goes into an empty degenerate orbital rather than
pairing up

, Atom Name of Atomic 1s 2s 2px 2py 2pz
element number
H Hydrogen 1 ↑
He Helium 2 ↑↓
Li Lithium 3 ↑↓ ↑
Be Beryllium 4 ↑↓ ↑↓
B Boron 5 ↑↓ ↑↓ ↑
C Carbon 6 ↑↓ ↑↓ ↑ ↑
N Nitrogen 7 ↑↓ ↑↓ ↑ ↑ ↑
O Oxygen 8 ↑↓ ↑↓ ↑(↓) ↑(↓) ↑(↓)

2px, 2py, 2pz have same energy level → chance that two electrons in one p shell is equal

Only the most right row in the periodic table is stable because it has a closed shell
Octet rule: atoms are most stable when their outmost shell is filled
Hydrogen is very reactive because it can lose an electron or gain an electron
• Lose: proton
• Gain: hydride ion

Electrostatic potential map: you can see if an element is positive or
negative
Ionic interaction / ionic band: combination of ions to adhere to the
octet rule

Sharing electrons results in covalent bonds
• Polar bonds: higher electronegativity
o H-Cl & C=O
• Apolar bonds: dissolves in water
o C-H & H-H
Electronegativity: increases → & ↑

Continuum of bonds:
• Ionic bonds: > 2.0
• Polar bonds: < 2.0 & > 0.5
• Apolar bonds: < 0.5

1 electron means that the molecule can only form one bond

Lone pair: a electron pair that does not have to form a bond with another molecule
• H: 1 bond
• C: 4 bonds
• N: 3 bonds, 1 lone pair
• O: 2 bonds, 2 lone pairs
• F, Br, Cl, I: 1 bond, 3 lone pairs

, Formal charge: number of valence electrons – (number of lone pair electrons + number
of bonds) (formele lading)

Lecture 2 Mayer 25-02-2020 Chapter 8.1-8.5
3D structures of molecules
• Kekulé: perspective
• Ball and stick model
• Electrostatic potential map

S orbitals are spherical
• 2s orbital has a node: place in the orbital where are no
electrons
• Two s orbitals form a sigma bond

Orbitals are conserved – molecular orbitals (MOs)
• Number of atom orbitals combined = the number of molecular
• σ*- antibonding orbitals
• If orbitals are conserved they cannot be destroyed

P orbital resemble dumbbells
• Two p orbitals form a pi bond
• Plates: no electron density

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Direct to-the-point

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.